IMPBIO

ACI IMPBio - Projet soutenu en 2003 et 2006


 

SINBIO

Statistique et INformatique intégrées à la BIOlogie des traits complexes

http://ecgene.net/Sinbio/

 

Coordinateur

L. Tiret

INSERM/U525                                            

Equipes partenaires :          

Responsable équipe 1



F. Cambien         



INSERM/U525

Responsable équipe 2

F. Demenais

INSERM/EMI 00-06

 

 

poster

Objectifs initiaux

Etablir le lien entre la variabilité du génome humain et les traits complexes constitue l'un des enjeux majeurs de la recherche post-génomique. Il apparaît de plus en plus évident que l'étude des maladies complexes requiert non seulement d'analyser la variabilité complète des gènes candidats, mais aussi d'aborder la variabilité génétique des systèmes biologiques dans leur ensemble. L'exploration moléculaire de la variabilité génétique ne constitue plus une étape limitante (du moins d'un point de vue technologique) grâce au développement d'outils de séquençage et de génotypage à haut débit. Le challenge actuel réside dans le développement d'outils statistiques et informatiques capables de traiter la grande quantité d'information générée par la biologie moléculaire. Les équipes impliquées dans le projet ont une grande expérience d'une part dans l'exploration de la variabilité moléculaire des gènes humains et le génotypage, et d'autre part dans le développement de nouvelles méthodes statistiques et d'outils informatiques (analyse haplotypique, fouille de données, modèles régressifs) destinés à modéliser la relation génotype/phénotype et à être appliqués dans de grandes études épidémiologiques. Afin d'améliorer la diffusion de ces outils auprès de la communauté scientifique, il est nécessaire de développer des interfaces graphiques conviviales et de les rendre disponibles sur le réseau Internet pour permettre leur utilisation "on line" à partir des bases de données que nous avons mises en place ou provenant de l'extérieur. Notre site web GeneCanvas (http://www.genecanvas.org/ ) offre un support idéal pour cela. Les compétences d'un ingénieur informaticien sont indispensables pour réaliser ce projet.



 

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