ACI IMPBIO

Bioinformatique, modélisation des systèmes biologiques

Journées 2007, ACI-IMPBIO - GDR BIM
4-5 Octobre, Institut Henri Poincaré (Paris)

GDR BIM

Institut Henri Poincare Pantheon


La biologie à grande échelle est à l'origine d'une masse considérable de données qui concerne tous les niveaux du vivant, depuis les gènes jusqu'aux espèces et aux systèmes écologiques. Au cours des dernières années, ces données se sont considérablement diversifiées (transcriptome, protéome, interactome, etc), et autorisent des analyses intégrées allant des séquences complètes des génomes aux conséquences phénotypiques de mutations, en passant par les aspects structuraux, fonctionnels et dynamiques des différents acteurs cellulaires. Ces problématiques sont au coeur de l'ACI Informatique, Mathématique et Physique en Biologie Moléculaire (IMPBIO), et du GDR de Bionformatique Moléculaire (BIM). Elles requièrent à la fois des modèles mathématiques et physiques qui représentent les lois complexes du vivant, et des travaux en informatique, pour simuler ou estimer ces modèles, fouiller les données, et pour intégrer toutes ces sources d'informations hétérogènes au sein de bases de données et de connaissances. Les années passées ont vu ces disciplines se développer de façon extraordinaire (les articles les plus citées aujourd'hui, toutes sciences confondues, sont liés à l'exploitation informatique des données génomiques). La biologie de demain sera largement faite par des biologistes "secs", modélisateurs et/ou bioinformaticiens. Ces deux journées seront l'occasion de faire le point sur les résultats récents et les perspectives pour les prochaines années.



Programme
Jeudi 4 octobre
  9h30 - 10h00 Réception, discours d'ouverture
10h00 - 10h50 Laurent Duret (BBE): Analyse comparative des génomes de primates: mais où est donc passée la sélection naturelle ? (slides)
10h50 - 11h10 Pause
11h10 - 12h00 Frédéric Cazals (INRIA-Sophia): Modèles pour la description de la structure des protéines: de la géométrie à la bio-physique en passant par les statistiques.
12h00 - 14h00 Déjeuner libre
14h00 - 14h50 Daniel Gautheret (IGM): Les gènes non codants des micro-organismes: accélérer l'acquisition des connaissances.
14h50 - 15h40 Eric Rivals (LIRMM): L'analyse de marqueurs minisatellites variables suggèrent de fréquents échanges génétiques entre sous-espèces de la souris commune Mus musculus. (slides)
15h40 - 16h10 Pause
16h10 - 17h00 Stéphane Robin (INAPG): Modèles d'analyse pour les puces CGH. (slides)
17h00 - 18h30 Discussion générale avec l'ANR et les organismes
18h30 - 19h00 Posters
19h00 - ... Apéritif buffet
Vendredi 5 octobre
  9h30 - 10h20 Thomas Simonson (LIX): Evolution des protéines: simulations et controle.
10h20 - 10h40 Pause
10h40 - 12h00 Posters
12h00 - 14h00 Déjeuner libre
14h00 - 14h50 Christine Froidevaux (LRI): Bases de données et intégration de connaissances.
14h50 - 15h40 Benno Schwikowski (Institut Pasteur): Two new computational approaches to increase proteome coverage by mass spectrometry. (slides)
15h40 - 16h30 Thé - Discussion


Le nombre de participants est limité à 200 personnes.

Pour trouver un hotel:
cybevasion-paris ou hotelsparisonline

Restaurants:
à proximité de l'Institut Henri Poincaré



CNRS Institut Henri Poincaré Ministère de la Recherche ANR

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